El cognom Comallonga és a bastament documentat a Sant Mateu de Bages des del segle XI. Aquesta família tenia vincles amb la capella de Sant Andreu de Comallonga, situada dins l'antic terme del castell de Sant mateu però que avui pertany al municipi de Fonollosa. Era una capella rural, vinculada a la parròquia de Sant Mateu, que està documentada per primera vegada el 1221. El mas Comallonga és probable que tingui el seu origen en època medieval, malgrat que les primeres referències que en coneixem són del segle XVII i estan vinculades a la família amb el mateix nom que el mas. De l'any 1607 es coneix una causa pia per donzelles maridar instituïda a la parròquia de Gualba per Melcior Comallonga, el qual pertanyia a la família propietària del mas Comallonga, que era qui pagava les pensions (NOGUERA, 1904: 27). La resta de notícies provenen de les diverses inscripcions de llindes de la casa, i la més antiga és de l'any 1656. En aquesta època es devia aixecar part del nucli més antic del mas. Al segle XVIII, com la majoria de masos, va tenir una ampliació important. En donen testimoni dues inscripcions, una del 1787 i una altra del 1773. Aquesta última especifica que és un fadrí de la casa, Pere Comallonga, qui va contribuir a les obres. Finalment, trobem dues inscripcions més, que corresponen al 1812 i 1881 respectivament. Per tant, al segle XIX la casa fou novament ampliada per adquirir l'aspecte actual. Els Comallonga van continuar vinculats a aquest mas fins al segle XX, quan van marxar a Sabadell. A la dècada de 1970 el doctor Carles Llussà, metge de Manresa, va adquirir el mas Comallonga. Tal com informa la darrera de les inscripcions, el 1976 va fer-hi obres de rehabilitació.
